Henrik Vaaler jobber som advokat hos Regjeringsadvokaten. Han jobber særlig med forvaltningsrett og menneskerettigheter.

Vaaler har i tillegg erfaring som kursunderviser i forvaltningsrett ved UiO. Han er medforfatter av bøkene Robins guide til rettskildelæren og Robins guide til forvaltningsretten.